颜宁点评AlphaFold2+外行买家秀:蛋白结构预测神器初体验( 三 )


当然了 , 说一模一样太夸张 , 还是有细微差别的 。 最重要的一点 , 右侧实验得到的结构里有一个化学小分子结合到蛋白上 , 这是一种生理调控下的蛋白状态;蛋白在有无化合物结合、不同化合物结合的状态下都会呈现不同的细微变化 , 而正是这些变化才体现了蛋白质的多样而神奇的功能 。 在这一点上 , AlphaFold给出了一个单一的最优解 , 是无法覆盖蛋白质的千姿百态的 。
但即便如此 , AlphaFold也是做到了此前人们无法想象和做到的事情 。
做了两个测试之后 , 自然就想到 , 如果随意给一段序列 , 能否轻松地得到一个结构模型呢?毕竟这才是AlphaFold最让人兴奋的地方 。 AlphaFold的正式运算需要的资源非常庞大 , 个人或者小团队如果家里没矿的话 , 想自己搭平台运算基本没戏;好在谷歌提供了一个免费的云端平台Colab(